法人別リリース

植物の種リストから生態系の「質」を測る

九州オープンユニバーシティ — Tue, 27 Oct 2026 15:52:08 +0900

植物の種リストから生態系の「質」を測る
5つの多様度指標と、217の未記載種を含む1050種のデータベースを開発

九州オープンユニバーシティ矢原徹一研究部長の研究チームは、ある場所に生えている植物の種リストから、その場所の生態系の「質」を5つの多様度指標で評価する方法を開発しました。ゲノム情報にもとづいて被子植物60属の分類を再検討し、217の未記載種を含む1050種について、分布と生態的な特徴をまとめたデータベースを構築したことでこの評価が可能になりました。国の生物多様性評価で「不足している」と指摘されてきた、種レベルの状態にもとづく生態系の指標を提供するもので、自然共生サイトやモニタリングサイト1000などでの活用が期待されます。
ポイント
植物の種リストから、生育地型・生活型・開花期・種子散布型・送粉型の5つの多様度指標を計算し、生態系の「質」を評価する方法を開発しました。
ゲノム情報にもとづく高精度の系統解析により被子植物60属の分類を再検討し、217の未記載種を含む1050種の分布・生態形質データベースを構築しました。
これまで1種とされてきたタニギキョウ属が21種に分かれるなど、「隠れた地域固有種」が多数見つかりました。これをもとに、地域ごとの固有性を地図化しました。
※印の用語は、末尾の「用語解説」で説明しています。

背景：なぜ「生態系の質」の指標が必要か 2023年に閣議決定された『生物多様性国家戦略2023－2030』は、基本戦略1に「生態系の健全性の回復」を掲げています。2030年までに陸と海の30%以上を保全する「30by30目標」（※）の達成に向けて、保護地域とOECM（※）による保全を進め、普通種を含めた生物群集全体を守ることで、生態系の健全性を回復させるという方針です。この目標を評価するために、次の3つの状態目標が設定されています。
全体として生態系の規模が拡大し、質が向上することで健全性が回復している。
種レベルの絶滅リスクが低減している。
遺伝的多様性が維持されている。

しかし、「生態系の質」の向上を含む「生態系の健全性」の回復を、どのような指標で測ればよいのかは未解決の課題です。2025年10月に公表された「生物多様性及び生態系サービスに関する総合評価2028（JBO4）に向けた中間提言」も、次のように指摘しています。

「個別生態系の各区分における生態系の質を測るデータについては、特に『種の個体数・分布域』『生物種数・多様性』といった種レベルの状態にもとづいた、全国的な経年トレンドを把握できる指標が不足している。」

今回の研究は、このニーズに応えるものです。

開発した5つの多様度指標研究チームは、被子植物60属についてゲノム情報（MIG-seq法※）にもとづく高精度の系統解析を行い、217の未記載種（※）を含む1050種を分類学的に再検討しました。そのうえで、正確な種同定にもとづく都道府県別の分布と、各種の生育地型・生活型・開花期・種子散布型・送粉型をまとめたデータベースを構築しました。
このデータベースを使うと、ある場所の植物の種リストから、5つの性質それぞれについて「さまざまなタイプの植物がどれだけ偏りなく揃っているか」を数値（多様度）として計算できます。多様度の計算には、シンプソンの多様度指数（※）を用いています。多様度が低い場合は、そのタイプを支える環境や、植物と動物との関係が失われているおそれがあります。

表1　5つの多様度指標の意味
指標
何を見るか
低いときに疑われること
生育地型多様度
森林・草地・湿地など、さまざまな環境に生える植物が揃っているか
草地や湿地など、特定の生育環境の消失
生活型多様度
木本・多年草・一年草など、さまざまな生き方の植物が揃っているか
管理放棄や過度の刈り取りなどによる植生の単純化
開花期多様度
春から秋まで、さまざまな時期に咲く植物が揃っているか
特定の季節の花資源の不足（送粉昆虫への影響）
散布型多様度
風・鳥・アリなど、さまざまな方法で種子を運ぶ植物が揃っているか
種子を運ぶ動物の減少
送粉型多様度
マルハナバチ・それ以外の昆虫・風など、さまざまな方法で花粉が運ばれる植物が揃っているか
特定の送粉者（花粉を運ぶ動物）との関係の喪失
　
評価例：九州大学伊都キャンパス評価例として、九州大学伊都キャンパスに自生する60属の被子植物の種リストから5つの多様度指標を計算し、福岡県全体の値と比べました（図1）。レーダーチャートの基準線は福岡県全体の値を1としたもので、太線は伊都キャンパスの値を福岡県の値で割った相対値です。

図1　九州大学伊都キャンパスの5つの多様度指標（福岡県全体の値を1としたときの相対値）

このチャートから、伊都キャンパスでは送粉型多様度がとくに低いことがわかります（送粉型多様度の相対値：0.73）。種リストを調べたところ、「マルハナバチ媒」（マルハナバチに花粉を運んでもらう植物）の種の割合が県全体よりとくに低いことが原因でした。この結果から、伊都キャンパスではマルハナバチ媒の植物の保全にとくに注意が必要だと考えられます。
この評価は特定の年の結果ですが、同じ評価を継続すれば、生態系の質が「回復」しているのか「劣化」しているのかという経年トレンドを把握できます。

過去の記録から経年変化を評価する過去から現在までの種組成の変化を記録したデータがあれば、それを使って生態系の経年トレンドを把握することもできます。
神奈川県では1979年以来3回にわたって組織的な植物分布調査が行われ、104の行政区ごとに1864種の在・不在が記録されています。この記録から、1864種のうち45%で生育地点数が減少していることがわかりました（Myotoishi et al. 2026、共同通信プレスリリース）。5つの多様度指標を104の行政区ごとに計算すれば、種の減少にともなって生態系の状態がどう変化したかを評価できます。
また、都道府県のレッドリストには、すでに絶滅した種が記録されています。たとえば神奈川県では118種が絶滅種とされています。これらの種が失われたことで、県全体の5つの多様度がどう変化したかも評価できます。
これらの解析は今後の課題です。

全国の地図で見る地域差 5つの多様度指標を計算するためのデータベースは、現時点では60属にとどまっており、より多くの属に拡充する作業を進めています。60属による評価でも、生活型多様度と送粉型多様度には明瞭な地理的傾向が見られます（図2）。

図2　生活型多様度（左）と送粉型多様度（右）の都道府県別地図。色が濃いほど多様度が高い。

データベースを使えば、多様度だけでなく、特定のタイプに属する種の割合も評価できます（図3）。たとえば湿地性の種や草地性の種の割合は、湿地や草地という、全国的に減少が著しい生育環境の状態を測る有力な指標になると考えられます。

図3　湿地性種の比率（左）と草地性種の比率（右）の都道府県別地図

固有性指標：見えてきた「隠れた固有種」分布データベースからは、地域の「固有性指標」も計算できます。固有性指標は、分布の狭さで重みづけした種数です。1つの都道府県だけに分布する種にはその都道府県に1を、2つの都道府県に分布する種にはそれぞれ0.5を、N個の都道府県に分布する種にはそれぞれ1/Nを与え、都道府県ごとに合計します。

図4　都道府県別の固有性指標値。左：217の未記載種にもとづく評価、右：既知の狭分布種にもとづく評価。左右で色の目盛りが異なる点に注意。

その結果、未記載種にもとづく評価でも、既知の狭分布種にもとづく評価でも、北海道・長野県・高知県・宮崎県・鹿児島県の固有性がとくに高いことがわかりました（図4）。
また、未記載種にもとづく評価（図4左）では、より多くの都道府県で固有性指標値が高くなりました。これは、これまで広く分布する1種と考えられてきた植物が、実は複数の地域固有種に分かれている例が数多く見つかったためです。60属のうち、とくに種数が大きく増えたのは次の属です。

表2　種数がとくに大きく増えた属　
属
これまで
今回の研究
増加
タニギキョウ属
1種
21種
21倍
サワハコベ属
2種（サワハコベ・ツカモトハコベ）
14種
7倍
ニワトコ属
2種
13種
6.5倍

自然共生サイトやモニタリングサイト1000などのモニタリングでは、このように地域分化が著しい属について、地域固有種が生育していないか慎重に調査する必要があります。

図５　日本産タニギキョウ属Peracarpaの多様性　左：21種の系統関係（MIG-seqデータによる最尤系統樹）　右：岡山県那岐山において同所的に生育するキビノタニギキョウとダイセンタニギキョウ

都道府県内の比較：北海道の自然保護区固有性指標は、都道府県内の地域間の比較にも使えます。北海道の8つの自然保護区（7つの国立公園と、富良野芦別道立自然公園の夕張岳）について、固有性指標値を求めました（この場合は、1つの保護区だけに分布する種に1を、N個の保護区に分布する種には各保護区に1/Nを与えて合計）。

図６　北海道の8つの自然保護区と保護区外（他地域）の固有性指標値

その結果、大雪山国立公園の値が最も高く（10.9）、夕張岳（富良野芦別道立自然公園、10.4）、日高山脈襟裳十勝国立公園（9.4）が続きました。一方、8つの保護区以外の地域の値は20で、大雪山国立公園のほぼ2倍でした。保護区外は面積が広いことも影響していますが、この結果は、北海道の固有種の多くが自然保護区の外にも生育しており、保護区外での保全も重要であることを示しています。

今後の展開このように、60属1050種の分布・生態形質データベースを使えば、特定のサイトや自然保護区について、生態系の「質」をさまざまな角度から評価できます。研究チームは、データベースをより多くの属に拡充するとともに、次のような指標種についての評価方法を開発し、『生物多様性国家戦略2023－2030』基本戦略1「生態系の健全性の回復」の評価に貢献していく予定です。

〇連続的減少種：絶滅危惧種としてレッドリストに掲載されてはいないが、連続的な減少トレンドが観察されている種
〇遺伝的劣化種：絶滅危惧種としてレッドリストに掲載されてはいないが、種分化の過程でボトルネックを経験し、有効集団サイズが大きく減少した種
〇地理的分化種：絶滅危惧種としてレッドリストに掲載されてはいないが、MIG-seqによる系統解析・集団遺伝解析において顕著な地域系統の分化があり、地域系統の保全が必要な種
〇送粉ネットワークのキーストーン種：各季節において送粉ネットワークのハブとなる種
〇アンブレラ種：分布データベース上で、多くの種と分布が重複する優占種
〇フラッグシップ種：社会的注目度が高くWeb上での言及件数が多い種

お問い合わせこの方法を活用した自然共生サイトなどの評価をご希望の方は、九州オープンユニバーシティ事務局までお問い合わせください。
九州オープンユニバーシティ事務局　【 E-mail:kyushu.open.univ.office@gmail.com 】

用語解説用語
説明
30by30目標
2030年までに陸と海の30%以上を保全することをめざす国際目標。
OECM・自然共生サイト
保護地域以外で、生物多様性の保全に貢献している地域（Other Effective area-based Conservation Measures）。自然共生サイトはOECM拡充を進めるための日本独自の保護制度で、民間などの取り組みによって生物多様性の保全が図られている区域を、国が認定する。既設の保護区と重複しない自然共生サイトはOECMに該当する。
モニタリングサイト1000
環境省が全国約1000か所の調査地で、生態系の状態を長期にわたって継続調査している事業。
MIG-seq法
ゲノム全体から多数のDNA領域を一度に読み取り、個体差がある領域を特定する法。この方法で得られるDNAの個体差データにもとづいて、近縁な種どうしの系統関係を高い精度で決定することができる。
未記載種
存在が確認されているものの、まだ学名がつけられていない（論文で記載されていない）種。論文で学名が発表された時点で「新種」として認定される。
シンプソン多様度
生物群集から無作為に2個体を抽出したとき、それらが異なるタイプである確率をあらわす指標（0〜1の範囲をとり、1に近いほど多様性が高い）。
送粉
花粉が昆虫や鳥、風などによって運ばれ、受粉が起こること。花粉を運ぶ動物を送粉者という。

研究体制この研究は、環境研究総合推進費「ゲノム情報と正確な同定にもとづく維管束植物の統合データベース構築と多様性指標・保全優先度の地図化技術の開発」（2023～2025年度、研究代表者：矢原徹一）により実施されました。

新種植物200種超を発見した植物学者が書く科学ファンタジー『花神戦記』、第50話で「九州編」完結 ― 大雪山から屋久島まで、物語の舞台となった自生地をつなぐ保全の輪を

九州オープンユニバーシティ — Thu, 22 Oct 2026 15:00:00 +0900

植物学者の矢原徹一（ペンネーム：谷桔梗）は、物語投稿サイト「TALES」で連載中の科学ファンタジー小説『花神戦記（かがみせんき）』第50話「キリシマイバラ－龍王を呼ぶ花」を【2026年10月23日】に公開します。これにより、福岡の雷山から霧島山まで九州各地を巡る中盤の山場「九州編」が完結します。本作は、200種を超える新種植物を発見してきた著者が、自らの野外調査の体験をもとに執筆しています。日本の野生植物の魅力と、いま自生地で起きている危機を、物語を通して多くの読者に届けることを目指しています。

『花神戦記』とは ― 現実の野外調査と、夢の世界の冒険が交差する物語

主人公は、伊都大学に入学したばかりの18歳の少女、房桜知花（ふさざくら・ちか）。彼女は谷桔梗教授が執筆した『保全生態学入門』を高校生時代に読んで、人と花の共生をめざす科学があることに感銘を受け、伊都大学に入学します。そして谷教授が守った伊都大学生物多様性保全ゾーンに足を踏み入れた途端、彼女の脳裏に衝撃が走ります。そこは、彼女が毎晩のように見る夢に登場する花学校の景色と瓜二つでした。夢の世界では、知花は花の自生地を守る「花守」の娘。彼女には、花に宿る神「花神（かがみ）」の姿が見え、言葉を交わすことができる不思議な力があります。花学校で「花狩人」に出会ったことがきっかけで、彼女はハカセや先輩とともに、花の世界を救う「神の花」を求めて旅立ちます。現実の世界では、憧れの谷桔梗教授の野外調査に同行し、未知の植物を探して全国の山を歩きます。
現実の調査で新種を見つけた場所に、夢の世界では「神の花」が咲き、花を奪う「花狩人」との戦いが始まります。二つの世界を行き来する構成により、読者は冒険を楽しみながら、植物を見分ける目の付けどころ、新種が「新種」と判断されるまでの過程、そして自生地が直面する厳しい現実を自然に学ぶことができます。

物語のもう一つの柱は、古事記の神々と各地に伝わる民話・伝説です。知花の旅の目的は、世界を救う神イザナギへの扉を開くこと。その行く手には、花神が見える者を狙う邪神イザナミが立ちはだかります。旅の途中では、富士の峰に座すコノハナサクヤヒメ、翡翠を守る女神ヌナカワヒメ、水を司る瀬織津姫といった神々が知花を導きます。北海道ではアイヌの人々が敬うカムイが、各地の山ではその土地に古くから伝わる守り神が、花神とともに現れます。神話や民話の神々は、その土地の自然と深く結びついています。物語の中で神々と出会うことは、その土地にしか咲かない植物と出会うことでもあります。
物語は屋久島から始まり、北海道（アポイ岳・夕張岳・大雪山）、信州（中央アルプス・白馬・戸隠）、北陸・白山、尾瀬へと全国に広がってきました。第33話から始まった「九州編」は、その中盤の山場です。

九州編の見どころ •         実在の自生地が舞台　雷山、くじゅう連山、阿蘇、宮崎の白岩山、祖母山、甑島、対馬、霧島山。読者は、知花とともに九州の山と島を巡ります。
•         自生地の「いま」を描く　シカに食べ尽くされて緑が消えた森、野焼きで守られてきた草原、再発見できずに絶滅を確認するつらさ。現場を知る著者ならではの描写が続きます。
•         新種発見の瞬間　「ここに新種があるはず」と地形を読み、標本と照合し、似た種との違いを確かめる。研究者の思考過程が、ミステリーのように描かれます。
•         神話と伝説の地を巡る　雷山では山に宿る土地神・清賀上人が、くじゅうでは古事記に登場する鹿の神アメノカクが登場します。阿蘇では、外輪山を蹴破って湖を野に変えたと伝わるタケイワタツが現れます。祖母山では大蛇の姿で聖域を守る豊玉姫が、霧島では大浪池に宿る龍王が知花たちの前に姿を見せます。阿蘇の「蹴裂伝説」は、かつて実在したカルデラ湖の消失と重ねて語られます。神話や伝説の背後にある土地の自然史にも光を当てています。
•         敵にも「花を愛する理由」がある　敵役の三人衆は、失われた自生地への絶望から、植物を移植し「花園で守る」道を選んだ者たちです。自生地で守るか、移して守るか。保全の現場にある価値観の違いが、物語の対立軸になっています。
•         もうひとりの夢見人　夢の世界で敵対する少女・葛原里花が、現実の世界にも実在していました。二人の関係の行方が、九州編を貫くドラマです。

九州編の舞台と主な登場植物
•         第33〜35話（福岡・水無、雷山）：ミズナシハコベ、ライザンクルマバナ、ライザンミズ
•        第36〜38話（くじゅう連山）：モモイロウツギ、ツクシコウツギ、クジュウオトギリ
•        第39〜40話（阿蘇）：キュウシュウハガクレツリフネ、カヤノウメバチソウ
•        第41〜42話（宮崎県白岩山）：シライワアザミ、シライワアケボノソウ
•        第43〜44話（祖母山・障子岳）：ウバタケギボウシ、ブンゴギボウシ、タシロノガリヤス
•        第45〜46話（甑島）：コシキイトラッキョウ、コシキノダケ、コシキヒヨドリ
•        第47〜48話（対馬）：オオチダケサシ、ツシマヤマラッキョウ
• 第49話（伊都大学・生物多様性保全ゾーン）：ガマ。ミズオオバコ、ヒシ
• 第50話（霧島山・えびの高原）：キリシマイバラ

なお、『花神戦記』に登場する植物については、谷桔梗の新種植物発見伝（https://note.com/tetsukazuyahara）という記事に、写真入りで解説されています。
第50話では、白岩山・甑島・対馬で出会った三柱の花神の力を集め、知花たちは霧島での決戦に挑みます。そして物語は、夢の世界と現実世界の両方に密かに影を落とす本当の敵の存在へと近づいていきます。知花が毎晩のように見る夢－その夢の世界が次第に現実世界と交差し始めます。夢の世界とはいったい何なのか？　物語の核心に位置するミステリーが具体的な姿を現します。

新種を探し続けた植物学者が、小説を書く理由
著者は、2020年以来の日本各地の野外調査で200種を超える新種植物を発見してきた植物学者です。作中で谷教授が見せる「地形を読んで急斜面に向かう」ような調査の姿や、標本と野外の個体を見比べて新種だと確信する場面には、著者自身の経験が反映されています。
一方で著者は、調査地で植物が消えていく現場も見てきました。シカの食害、草原の減少、水辺の環境の変化、そして盗採。新種として名前がつく前に、絶滅の危機にある植物も少なくありません。論文や報告書では、こうした現実は一部の専門家にしか届きません。そこで著者は、花に神が宿るファンタジーの形を借りて、野生植物のすばらしさとその危機を広く伝えることにしました。
作中に登場する植物の姿、花の色、生えている岩や土、シカに食べられた森の匂いまで、描写は現地での観察に基づいています。一輪一輪の花に「花神」として人格を与えることで、名前も知られていない小さな植物にも、それぞれの個性と物語があることを伝えています。
著者は植物学の研究のかたわら、古事記や各地の民話にも親しんできました。神話や民話には、その土地の山や川、そこに暮らす生きものへの人々のまなざしが刻まれています。『花神戦記』では、古事記の神々や民話のキャラクターを花神とともに登場させています。なじみのある神話や民話を入り口に、その土地にしか咲かない固有の植物へと読者の関心を広げることをねらっています。
【著者コメント】
「新種を見つけた瞬間の高揚と、その花が絶滅の危機に直面している悲しさ。その両方を、少しでも多くの人に伝えたいと思い、この物語を書き始めました。日本の山や島には、まだ名前のついていない植物がいまも咲いています。知花と一緒に旅をしたあと、近くの野山で足もとの花に目を留めていただけたら、これ以上の喜びはありません」

大雪山から屋久島まで ― 物語の舞台をつなぐ保全の輪へ
『花神戦記』の舞台は、北は大雪山から南は屋久島まで、その多くが実在する新種植物の自生地です。著者は、物語をきっかけにこれらの自生地をつなぐ保全活動を生み出したいと考えています。
自生地の多くは山間部や離島にあり、それぞれの地域で守り手が不足しています。一方、シカの食害や草原の減少など、各地が抱える課題には共通するものが少なくありません。物語の中で知花が各地の花神と仲間になっていくように、現実の世界でも、自生地を守る人々と、物語を読んで花に関心を持った読者とをつなぐことを目指します。
構想している取り組みの例は次のとおりです。
•         物語の舞台となった自生地で保全に取り組む地域の団体・自治体・研究者との連携
•         作品に登場する植物と自生地の現状を紹介する情報発信
•         読者が自生地の保全活動に参加・支援できる仕組みづくり
作品の教材としての活用、自生地での取材・調査、保全活動へのご協力に関するご相談も歓迎します。

【著者プロフィール】
矢原徹一（ペンネーム：谷桔梗）：九州大学名誉教授、福岡市科学館館長、一般社団法人九州オープンユニバーシティ研究部長。保全生態学・植物分類学を研究。九州大学退職（2020年3月）以来、日本各地を調査し、これまでに200種を超える新種植物を発見。

神奈川県の在来植物の45%で生育地が減少

九州オープンユニバーシティ — Sun, 20 Sep 2026 17:30:00 +0900

神奈川県の在来植物の45%で生育地が減少
市民による長期調査で明らかになった在来植物1,864種の生育地の消失と拡大

研究のポイント
・300人以上の市民ボランティアが関与した約40年間の長期調査データをもとに、神奈川県に生育する在来植物1,864種の生育地点数の増減傾向を明らかにした
・1979年から2017年にかけて、835種で生育地点数が減少し、688種で増加していた
・絶滅危惧種でないにもかかわらず、絶滅危惧種以上の速度で生育地が消失している「潜在的な絶滅危惧種」53種を特定した

研究の概要
九州大学大学院システム生命科学府・博士後期課程夫婦石千尋氏（現：東京大学大学院農学生命科学研究科・特任研究員）、九州大学大学院理学研究院・佐竹暁子教授、神奈川県立生命の星・地球博物館・大西亘主任学芸員、九州オープンユニバーシティ・矢原徹一研究部長らの研究グループは、1979年から2017年にかけて、神奈川県において市民により集められた植物の分布情報をもとに、神奈川県に生育する在来維管束植物1,864種のうち44.8%（835種）でその生育地が減少傾向にあり、36.9%（688種）で増加傾向にあることを明らかにしました。　

本研究は、日本において普通種を含む多数の在来植物種を対象に、生育地の長期的な増減傾向を初めて評価しました。また、本研究の成果は、絶滅危惧種だけでなく普通種においても生育地が減少していることを明らかにするとともに、神奈川県以外の地域においても、幅広い植物種の分布情報を集積し、その現状を評価することの重要性を示しています。本論文は、2026年9月16日に国際学術誌「Communications Biology」にオンライン公開されました。

研究の背景
近年、急速な土地利用の変化や気候変動などにより、多くの植物で生育地の消失が進行しています。特に、イギリスやオランダをはじめとするヨーロッパ諸国では、市民ボランティアが主体となり、国内に生育するほとんどの植物種を対象に、その分布を網羅的かつ継続的に調査してきました。こうした長期的な調査データにもとづき、これらの国々では、絶滅危惧種かどうかを問わず、幅広い植物種の現状評価が継続的に行われています。

日本では、1990年代以降、環境省レッドリストや都道府県版レッドリストの改訂を通じて絶滅危惧植物の現状評価は定期的に行われてきました。一方で、広い地域に生育する「普通種」や、絶滅危惧種に指定されていない種については、国および都道府県スケールでの現状評価は行われてきませんでした。

本研究の対象地である神奈川県は、1979〜1987年、1996〜2000年、2013〜2017年という3期間において、県内に生育する維管束植物約3,000種を対象とした分布調査が、市民ボランティアによって実施されてきました。この調査では、神奈川県を市町村などの行政区境界に沿って約110の調査区に分け、各調査区において、それぞれの植物種が生育しているかどうかが調べられました。これにより、神奈川県では、約40年間にわたって県内の植物の分布の変化を比較できる長期的なデータが蓄積されています。

さらに、神奈川県の調査では、対象種が確認された場合、必ず「標本」が作成されました。そのため、記録された植物が本当にその種であったのかを、後から第三者が確認することができます。また、近年のゲノム解析などによって植物の分類が見直された場合にも、作成された標本をもとに、最新の分類に合わせて記録を更新することができます。このように、すべての記録が標本によって裏付けられた長期的な分布データは国際的にも非常に限定的です。

研究の内容と成果
本研究では、在来維管束植物1864種を対象に、1979〜1987年、1996〜2000年、2013〜2017年の3期間について、生育が確認された調査区数の増減傾向を調べました。

その結果、県内の在来植物の45％を占める835種で、生育が確認された調査区数は減少していました。特に減少が顕著だったのは、草原、林縁、畑地など、いわゆる「里山」の構成要素である、人の管理によって維持されてきた二次的な自然環境に生育する種でした。

一方で、県内の在来植物の37%にあたる688種では、生育が確認された調査区数は増加しており、特に常緑樹林に生育する種でその傾向が顕著でした。なかでも、暗く湿った林床に生育する菌従属栄養植物（光合成をせず菌類に寄生する植物）やシダ植物では、その分布が大きく拡大していました。

こうした変化の背景には、かつて薪や炭を得るために人の手によって管理されてきたコナラやクヌギなどで構成される薪炭林が、化石燃料の利用や生活様式の変化によって管理されなくなり、常緑樹林が優占する森林へと遷移してきたことが挙げられます。

さらに本研究では、生育が確認された調査区の減少にもとづき、各種において「生育地の消失率」を算出しました。その結果、絶滅危惧種に指定されていない53種で、生育地の消失率が、神奈川県の絶滅危惧種における消失率の中央値以上であることが明らかになりました。つまり、絶滅危惧種に指定されていない種でも、生育地が急速に減少しているということを示しています。本研究ではこうした種を「潜在的な絶滅危惧種」と定義しました。潜在的な絶滅危惧種には、オミナエシ、ナンバンギセル、メガルカヤ、タムラソウなどの草原に生育する種のほか、ネバリタデやハコネヒヨドリなど、林縁環境に生育する種も含まれていました。

一方で、1,864種全体の消失率は、1979〜1987年の第一回調査から2013〜2017年の第三回調査にかけて有意に低下していました。このことから、神奈川県の在来植物では、生育地の減少が緩やかになっていることがわかりました。ただし、あくまで減少の程度が緩やかになっているだけであり、近年においても生育地の消失が続いていることには注意する必要があります。

今後の展開
草原や畑地などの二次的な自然に生育する種の減少には、こうした環境が国立公園などの従来の保護地域だけでは十分に保全されにくいことが一因となっている可能性があります。現在、環境省により、民間企業の社有林や里地里山、都市の緑地など、さまざまな主体によって適切に管理され、生物多様性が維持されている場所を「自然共生サイト」として認定する取り組みが進められています。その認定や管理においては絶滅危惧種が着目される傾向にありますが、これまで身近に見られた「普通種」の中にも減少している種がある可能性を考慮し、普通種の変化にも目を向けながら、その場所や地域全体の生物多様性が維持されているかを評価していく必要があると考えています。

著者コメント
今回、神奈川県において、普通種から絶滅危惧種まで幅広い植物の現状を評価することができたのは、地域の植物に精通した非職業研究者や市民ボランティアの方々によって、長年にわたり継続的な分布調査が実施されてきたためです。幅広い種においてその長期的な分布の変化に捉えるためには、このような市民と共同した調査が不可欠です。

日本では、多くの都道府県に、地域の植物に精通した市民を中心とする調査グループが存在し、長年にわたって植物の分布情報が蓄積されてきました。今後は神奈川県以外の地域についても蓄積されてきた既存の分布情報を活用し、普通種を含む幅広い植物の現状評価を行いたいと考えています。

同時に、市民主体の調査グループや、その活動を支え、収集された標本の収蔵・管理を担う地域の自然史博物館などに対して、行政や民間による継続的な財政支援を充実させていくことも重要と考えます。これらの活動によって蓄積される分布情報や標本は、環境省および都道府県版レッドリストの作成を支える基礎資料であるとともに、地域の生物多様性の変化を把握し、科学的根拠にもとづく保全施策を検討するための重要な情報基盤となります。こうした基盤を、一部の市民や研究者の活動のみに依存するのではなく、社会全体で継続的に支える仕組みを構築する必要があると考えます。地域の自然を長期にわたって記録し、その変化を捉え続ける体制を維持することは、日本の生物多様性保全を支えるためには不可欠です

論文情報
雑誌名：Communications Biology
論文タイトル：Citizen science reveals patterns of distributional decline and expansion across 1864 native vascular plant species in Kanagawa, Japan
著者：Chihiro Myotoishi, Akiko Satake, Wataru Ohnishi, Tetsukazu Yahara
論文リンク：https://doi.org/10.1038/s42003-026-10929-y

　
図：本研究で特定された潜在的な絶滅危惧種の例（左：オミナエシ、右：ナンバンギセル）

世界自然遺産屋久島において植物の新種ヤエダケオトギリを発見

九州オープンユニバーシティ — Thu, 09 Jul 2026 15:37:58 +0900

世界自然遺産屋久島において植物の新種ヤエダケオトギリを発見

九州⼤学⼤学院農学研究院の髙橋⼤樹助教、東北⼤学⼤学院農学研究科の陶⼭佳久教授・⽯川直⼦特任准教授、兵庫教育⼤学⼤学院学校教育研究科の⼭本将也講師、九州オープンユニバーシティの⽮原徹⼀研究部⻑（九州⼤学名誉教授）らの研究グループは、世界⾃然遺産である屋久島に、外⾒は⾮常によく似ているものの、それぞれ異なる種から進化した2 種類のオトギリソウ属植物が⽣育していることを明らかにし、新種「ヤエダケオトギリ」と新変種「ヤクシマオトギリ」として発表しました。
両者は葉や花弁の⼤きさが1cm にも満たない⼩型の草本植物であり、屋久島の⾼標⾼域では隣接して⽣育している場所もあります。外⾒では葉と萼（がく）の腺点形態でしか識別できず、⼀⾒しただけでは区別が困難であるため、これまで同⼀種として扱われてきました。ところが遺伝解析の結果、2 種は別種レベルで遺伝的に⼤きく分化しており、その進化的な起源も異なることが明らかになりました。
つまり、この外⾒の類似性は、それぞれが独⽴に獲得した収れん進化(※1)の結果であると考えられます。さらに両者は染⾊体数も異なっており、雑種は正常な花粉や卵細胞を作ることができないため、種の境界を崩さず島内にて共存できていると考えられます。
今回の発⾒は、これまで⻑年にわたり植物調査が⾏われ、年間1 万⼈以上もの登⼭者が訪れる屋久島の登⼭道沿いに、なお未発⾒の新種植物が存在していたことを⽰すものです。本成果は、屋久島の未だ⼗分に解明されていない⽣態系の豊かさを改めて⽰す重要な成果であると考えられます。
本研究成果は植物分類学の専⾨雑誌「Acta Phytotaxonomica et Geobotanica」に2026 年6 ⽉30 ⽇（⽕）（⽇本時間）付で掲載されました。

107年ぶりに新種の野生バラ（キリシマイバラ）を発見

九州オープンユニバーシティ — Tue, 18 Nov 2025 15:10:35 +0900

107年ぶりに新種の野生バラ（キリシマイバラ）を発見
私たちは、宮崎県えびの市えびの高原において、新種の野生バラを発見し、キリシマイバラRosa kirishimensis Yahara & Taganeと名付けて発表しました。
最初に発見された日本産の野生バラは、1784年にツンベルクThunbergによって発表されたノイバラです。その後アズマイバラ（1878年）、フジイバラとヤブイバラ（1909年）、ヤマイバラ・ミヤコイバラとハコネイバラ（1917年）、ツクシイバラ（1918年）が発表されました。しかしツクシイバラを最後に107年間、新種は見つかっておらず、バラ属の種はすべて見つかったと思われてきました。
私たちは、えびの市えびの高原に自生するキリシマイバラが、よく似たヤブイバラR. onoeiから以下の点で区別できることを明らかにしました。
・キリシマイバラでは葉の裏が白色を帯びるが、ヤブイバラでは白色を帯びない。
・キリシマイバラの花冠はより大型で径1.7–3.2 cm（ヤブイバラでは1.2–1.7 cm）。
・キリシマイバラの雄蕊は長さ3.9–9.6 mm（ヤブイバラでは4 mm以下）。
・キリシマイバラの花弁は通常ピンク色を帯びる（ヤブイバラは白色）。
私たちは、キリシマイバラの系統的位置を決定するために、ゲノム上の遺伝的な違いを効率良く評価できるMIGseq (Multiplexed ISSR Genotyping by sequencing)法を用いて、高精度の系統樹を描きました。
その結果、キリシマイバラはヤブイバラに近縁ですが、ヤブイバラとは明瞭に異なるクラスターを形成することがわかりました。ヤブイバラはキリシマイバラが自生する宮崎県えびの市にも分布しています。同じ地域に自生していながら明瞭に異なるクラスターを形成することから、キリシマイバラとヤブイバラは生殖的に隔離された別種だと考えられます。
鹿児島大学などに所蔵されている標本を調べた結果、キリシマイバラは霧島山の1150～2000 mでのみ採集されている固有種であることがわかりました。これまで霧島山固有種として、ノカイドウMalus spontanea (Makino) Makinoが知られています。キリシマイバラは霧島山の第二の固有種と考えられます。キリシマイバラは、えびの高原の狭い範囲で約20個体（開花個体）しか見つかっていません。絶滅危惧I類（CR）に相当する絶滅危惧種です。自生地では、高密度化したキュウシュウジカの採食によって植生に大きな影響が出ています。キリシマイバラに対するシカの採食の影響を把握し、適切な保全対策を検討する必要があります。
また、高知県瓶ケ森林道に自生し、これまでフジイバラに同定されてきたシコクイバラは、神奈川県・静岡県に自生するフジイバラと形態的に異なることに気づきました。MIGseq (Multiplexed ISSR Genotyping by sequencing)法を用いて、高精度の系統樹を描いた結果、シコクイバラはフジイバラR. fujisanensisに近縁ですが、フジイバラとは異なる、独立したクラスターを形成しました。シコクイバラとフジイバラは以下の形態的特徴によって区別されます。
・シコクイバラはより幅広い小葉を持つ（図３：大型の頂小葉は幅1.4–2.1 cmに、大型の側小葉は幅1.2–1.8 cmに達する。これに対してフジイバラの頂小葉は幅0.6–1.3 cm、側小葉は幅0.6–1.1 cmである）。
・シコクイバラはより大型の花をつける（図３：花は径3–3.5 cmである。これに対してフジイバラの花は径2.5–3 cmである）。
フジイバラは、富士山周辺地域や箱根地域の火山環境に適応した植物ですが、シコクイバラは変成岩（苦鉄質片岩）や堆積岩（礫岩）などの非火山性環境に生育しています。
以上のような形態的・生態的違いを考慮し、シコクイバラをフジイバラの亜種R. fujisanensis subsp. shikokumontana Yahara & Se.Fujiiとして記載しました。シコクイバラの自生地でもシカの採食圧が高まっており、その個体群の状態を注意深くモニタリングする必要があります。
バラ属の植物は園芸用に広く栽培されるため、その分類については古くから関心がもたれてきました。そのバラ属で新種が発見されたことは、驚きです。今回の発見を契機に、バラ属の野生種の分類学的再検討を進めることで、さらなる新分類群が発見されるかもしれません。
なお、私たちの研究チームでは日本全国で多くの新種候補を発見し、『新種候補植物図鑑速報版１・２』を出版しました。
https://www.amazon.co.jp/s?k=%E6%96%B0%E7%A8%AE%E5%80%99%E8%A3%9C%E6%A4%8D%E7%89%A9%E5%9B%B3%E9%91%91&adgrpid=161152995975&hvadid=696134558294&hvdev=c&hvexpln=0&hvlocphy=9197727&hvnetw=g&hvocijid=16897416966472914846--&hvqmt=e&hvrand=16897416966472914846&hvtargid=kwd-2304473180553&hydadcr=13896_13573125&jp-ad-ap=0&mcid=f8da19c80e6934fb9b17f8acdd220af5&tag=googhydr-22&ref=pd_sl_1ud1hac9zt_e
これらの新種候補について、今後引き続き記載論文を発表していきます。

論文へのリンク：
https://www.jstage.jst.go.jp/article/jjapbot/100/5/100_ID0326/_article
論文タイトル：日本産バラ属の2 新分類群―キリシマイバラ（新種）とシコクイバラ（新亜種）
Two New Taxa of Rosa (Rosaceae) from Japan: R. kirishimensis and R. fujisanensis
著者：矢原徹一1，田金秀一郎2，廣田峻3，藤井聖子4，布施健吾1，佐藤広行1，社川武徳5，陶山佳久6
（1九州オープンユニバーシティ，2鹿児島大学総合研究博物館，3大阪公立大学附属植物園，4高知県立牧野植物園，5九州大学システム生命科学府，6東北大学農学研究科附属複合生態フィールド教育研究センター）
掲載誌：Journal of Japanese Botany 100(5): 398–415 (2025).
要旨：日本の九州と四国において，バラ属（Rosa，バラ科）の2 つの未知分類群を認識した．これらの分類学的な実態を明らかにするため，MIG-seq 法を用いて36 サンプルについての系統解析を行なった．SplitsTree および最尤法による系統解析の結果，九州の分類群は，同地域にも分布するヤブイバラR. onoei Makino に近縁であることが示された．しかし，この分類群は，葉の裏面が帯白色であり，花がより大きく，雄しべがより長く，花弁がふつう淡紅色であることにより，ヤブイバラから形態的に識別可能であった．したがって，この分類群を新種キリシマイバラR. kirishimensis Yahara & Taganeとして記載する．一方，四国の分類群は，フジイバラR. fujisanensis (Makino) Makino subsp. fujisanensis に類似しているが，より広くより円形の小葉と，より大きな花により識別される．この分類群はMIG-seq データにもとづくSTRUCTURE解析および主成分分析により，その遺伝的構成はフジイバラと非常に類似していることが示されたが，最尤系統樹においてフジイバラから独立したクレードを形成した．これらの証拠に基づき，本分類群をフジイバラの新亜種シコクイバラR. fujisanensis subsp. shikokumontana Yahara & Se.Fujii として記載する．