Swift Biosciencesが精密医療イニシアチブのためにAccel-Amplicon Plusがんパネルを発売

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【アナーバー（米ミシガン州）2018年4月18日PR Newswire＝共同通信JBN】

＊新たな標的シーケンシング・ワークフローは変異の発見、特定を加速するため実証済みのコンテンツを容易なカスタム化と新たな分析のツールと一体化

Swift Biosciencesは18日、標的がんシーケンシングを促進する9つの腫瘍標的集中遺伝子パネルの一式であるAccel-Amplicon Plus(TM) Cancer NGS Panels（がん次世代シーケンシング（NGS）パネル）（https://swiftbiosci.com/products/accel-amplicon-plus-cancer-panels/ ）の発売を発表した。Accel-Amplicon技術は、臨床的に関連する遺伝子の包括的なエクソンレベルのホットスポットを把握するために単一のヌクレオチド変異体、コピー数多型（CNV）、小さな挿入と欠失の同時検出を可能にする。また、科学的目標達成に向けより有益で拡張性のあるワークフローを開発するため、検証済みのコンテンツと独自の標的をファスト・シングルチューブアッセイに組み合わせることもできる。

あらゆる腫瘍はゲノムの変化の独自の結合をはらんでおり、これが腫瘍の成長率や治療への反応を決定するかもしれない。集中・多重遺伝子パネルを利用した標的シーケンシングは既知の、または推定上のがん遺伝子内の臨床的に利用可能な変異を迅速に特定する正確で有益な手段を提供する。しかし、がん遺伝子パネルの開発にはアッセイを設計、最適化、有用化するために遺伝子マーカーや付加的なリソースを特定する生物情報科学の専門知識が必要である。

Accel-Amplicon Plusはトランスレーショナルラボラトリーに複数の戦略を利用する柔軟性を与えるモジュラーで雑多な組み合わせをする能力を提供する。ラボラトリーは広範な遺伝子のセットで総合的に腫瘍をプロファイルすることから始め、コンテンツを精査して最も有用なマーカーを抽出するか、あるいは、焦点を絞ったアッセイでスタートし、型通りに既知の臨床的に利用可能な変異体を選別することもできる。各アッセイはパネル当たり最大1500のアンプリコンに対応でき、Swiftの専門家によって設計され、ウェットラボ検証され、劣化したFFPE組織や希釈された液体生検検体にも十分対応できる。

Swift Biosciencesのチーフコマーシャルオフィサー（CCO）ヘイリー・フィスク氏は「Accel-Amplicon Plus Cancer Panelsはがん・腫瘍学研究を大きく変えるだろう。単一のパネルに実証済みでカスタム化可能なコンテンツをまとめることで、臨床研究者はあらゆる腫瘍標本から引き出されるデータを最大化し、がん変異体を発見、識別する取り組みを加速することができる」と語った。

Accel-Amplicon Plus Cancer Panelsは次の9種のアッセイで構成される：

疾患パネル

＊Accel-Amplicon Plus(TM) Colorectal Cancer Panel（結腸がんパネル）

＊Accel-Amplicon Plus(TM) Lynch Syndrome Panel（リンチ症候群パネル）

＊Accel-Amplicon Plus(TM) Lung Cancer Panel（肺がんパネル）

＊Accel-Amplicon Plus(TM) Myeloid Panel（脊髄パネル）

遺伝子パネル

＊ Accel-Amplicon Plus(TM) 57G Pan-Cancer Profiling Panel

＊Accel-Amplicon Plus(TM) Comprehensive TP53 Gene Panel

＊Accel-Amplicon Plus(TM) BRCA1 and BRCA2 Gene Panel

＊Accel-Amplicon Plus(TM) BRCA 1, BRCA 2 and PALB 2 Gene Panel

＊Accel-Amplicon Plus(TM) EGFR Pathway Panel

Accel-Amplicon Plus Cancer NGS Panelsの主要な特徴と利点は次の通り：

＊COSMICとClinVarのデータベースに網羅されている数千の臨床的に関係のある突然変異をカバーし、重要遺伝子のホットスポット領域やエクソンレベル、または全遺伝子レベルのものを含む

＊同じアッセイで生殖細胞系、体細胞系両方の変異を識別するため、対立遺伝子頻度1%未満のまれな変異を検知

＊劣化したFFPE標本や無細胞のDNA、細針吸引物、その他の生検などの限定的な検体からのわずか10ナノグラムの標本で確固たる成果を提供

＊Illumina（イルミナ）の全シーケンサーと互換性

極めて有益なコンテンツ、容易なプロトコル、信頼できる結果で、このパネルは次のような重要な腫瘍学用途に利用できる：

＊低頻度の体細胞変異の発見、または確認

＊新しい、または保存標本の腫瘍プロファイリング

＊疾病の感受性、早期発見、再発のスクリーニング

＊治療効果とモニタリング

Accel-Amplicon Plus Cancer Panelの発売と並行して、同社は広範なNGSデータセットの分析を促進するオープンソースと商業的ソリューションを提供するSwift Bioinformatics Resources （http://www.swiftbiosci.com/bfx ）を開始した。最初の2つのツールは、プライマートリミングのオープンソース・ツールであるPrimerclip（TM）と、アラインメント、アリールコーリング、サマリーリポートをシームレスに統合したGenialisの直感的な変異検出ソフトウエアであるFAST Analysis（TM）などSwiftの標的リシーケンシング・ワークフローをサポートする。

Accel-Amplicon Plus Cancer NGS Panels （https://swiftbiosci.com/protected-content/accel-amplicon-plus-cancer-panels-data-sheet_lead/ ）は現在、市販されている。詳細はwww.swiftbiosci.com を参照。

▽Swift Biosciencesについて

Swift Biosciencesは、NGSライブラリー調製企業である。米ミシガン州アナーバーに本社を置く同社は、全ゲノム・シーケンシング、標的DNAシーケンシング、エピジェネティック分析などの次世代シーケンシングに基づいた新たに出現したアプリケーションのための新規のライブラリー調製ソリューションを開発している。

Swift Biosciencesの製品は、顧客が難しい生物学的サンプルをより迅速かつ容易に、より高感度で高精度に分析するのをサポートするように設計されており、他方、主要器具類との互換性も備えている。Swift Biosciencesは、Pacific Biosciences（R）、Illumina（R）、Ion Torrent（TM）の3大シーケンシング・プラットフォームのすべてにライブラリー調製ソリューションを提供する初めての企業である。

同社は2010年2月に創業、その製品開発は、アグリゲノミクス（農業ゲノム科学）、医薬品、学術、バイオテクノロジー、腫瘍学の研究分野を含む多様な業界で、新しいアプリケーションを可能にする。

詳細はSwiftBioSci.com（https://swiftbiosci.com/ ）を参照、またはTwitter（@SwiftBioSci）でフォローを。

ソース：Swift Biosciences

▽問い合わせ先

Darby Wagner

Lambert, Edwards & Associates

+1 (616) 258-5779

dwagner@lambert-edwards.com

Swift Biosciences Launches Accel-Amplicon Plus Cancer Panels for Precision Medicine Initiatives

PR73134

ANN ARBOR, Michigan, April 18, 2018 /PRNewswire=KYODO JBN/ --

  - New targeted sequencing workflow combines pre-validated content with easy

     customization and new analysis tools to accelerate variant discovery and

                                screening

Swift Biosciences today announced the commercial release of its Accel-Amplicon

Plus(TM) Cancer NGS Panels

(https://swiftbiosci.com/products/accel-amplicon-plus-cancer-panels/ ), a suite

of nine tumor-specific and focused gene panels to facilitate targeted cancer

sequencing. The Accel-Amplicon technology enables simultaneous detection of

single nucleotide variants, copy number variants and small insertion and

deletions to achieve comprehensive and exon-level hotspot coverage of

clinically-relevant genes. It also allows researchers to combine pre-validated

content and their own targets into a fast, single-tube assay to develop more

informative and scalable workflows to better achieve their scientific goals.   

Every tumor harbors a unique combination of genomic alterations, which may

determine tumor growth rate and response to treatment. Targeted sequencing

using focused, multigene panels provides a precise and informative method to

quickly identify clinically actionable variants within known or putative cancer

genes. However, developing cancer gene panels requires bioinformatics expertise

to identify genetic markers and additional resources to design, optimize and

validate an assay.

Accel-Amplicon Plus provides a modular, mix-and-match capability that gives

translational laboratories greater flexibility to deploy more than one

strategy. Laboratories may either begin with a broad gene set to

comprehensively profile tumors and then refine the content to the most

informative markers, or start with a very focused assay to routinely screen

known, clinically actionable variants. Each assay can be designed to

accommodate up to 1500 amplicons per panel, are designed and wet-lab validated

by Swift's experts, and are fully compatible with degraded FFPE or diluted

liquid biopsy samples.  

"Accel-Amplicon Plus Cancer Panels could revolutionize cancer and oncology

research," said Haley Fiske, Chief Commercial Office at Swift Biosciences. "By

integrating pre-validated and customizable content into a single panel,

clinical researchers can maximize data generated from every tumor sample and

accelerate their efforts to discover and screen cancer variants."  

The Accel-Amplicon Plus Cancer Panels consist of nine assays:  

Disease Panels

    -- Accel-Amplicon Plus(TM) Colorectal Cancer Panel

    -- Accel-Amplicon Plus(TM) Lynch Syndrome Panel

    -- Accel-Amplicon Plus(TM) Lung Cancer Panel

    -- Accel-Amplicon Plus(TM) Myeloid Panel

Gene Panels

    -- Accel-Amplicon Plus(TM) 57G Pan-Cancer Profiling Panel

    -- Accel-Amplicon Plus(TM) Comprehensive TP53 Gene Panel

    -- Accel-Amplicon Plus(TM) BRCA1 and BRCA2 Gene Panel

    -- Accel-Amplicon Plus(TM) BRCA 1, BRCA 2 and PALB 2 Gene Panel

    -- Accel-Amplicon Plus(TM) EGFR Pathway Panel

Key features and benefits of the Accel-Amplicon Plus Cancer NGS Panels include:

    -- Covers thousands of clinically relevant mutations found in the COSMIC

       and ClinVar databases including those in hotspot regions and at the

       exon or whole-gene level of key genes

    -- Detects rare variants > 1% allele frequency to identify both germline

       or somatic mutations in the same assay

    -- Provides robust performance with as little as 10 nanograms sample input

       from degraded FFPE samples or limited specimens such as cell-free DNA,

       fine needle aspirates or other small biopsies

    -- Compatible with all Illumina sequencers

With highly informative content, an easy protocol and reliable results, the

panels enable several critical oncology applications, including:   

    -- Low frequency somatic variant discovery or confirmation

    -- Tumor profiling in fresh or preserved samples

    -- Screening for disease susceptibility, early detection and recurrence

    -- Therapeutic efficacy and monitoring

In parallel with the Accel-Amplicon Plus Cancer Panel release, the company

launched the Swift Bioinformatics Resources (http://www.swiftbiosci.com/bfx ),

an offering of open source and commercial solutions to expedite analysis of

large NGS data sets. The first two tools support Swift's targeted resequencing

workflow, including Primerclip(TM), an open source tool for primer trimming,

and FAST Analysis(TM), an intuitive variant detection software from Genialis

that seamlessly integrates alignment, allele calling and summary report.  

The Accel-Amplicon Plus Cancer NGS Panels (

https://swiftbiosci.com/protected-content/accel-amplicon-plus-cancer-panels-data-sheet_lead/

) are commercially available now.  Visit www.swiftbiosci.com to learn more.  

About Swift Biosciences

Swift Biosciences is the NGS Library Prep company. Based in Ann Arbor,

Michigan, the company develops novel library preparation solutions for emerging

applications based on next-generation sequencing, including whole genome

sequencing, targeted DNA sequencing, and epigenetic analysis.

Swift Biosciences' products are designed to help customers analyze challenging

biological samples faster, easier, and with greater sensitivity and accuracy,

while being compatible with leading instrumentation. Swift Biosciences is the

first company to offer library preparation solutions on all three major

sequencing platforms, including Pacific Biosciences(R), Illumina(R) and Ion

Torrent(TM).

The company opened its doors in February 2010, and its product development

enables new applications in multiple industries, including agrigenomics,

pharmaceutical, academic, biotechnology, and oncology research fields.

For more information, visit SwiftBioSci.com (https://swiftbiosci.com/ ) and

follow Swift Biosciences on Twitter (@SwiftBioSci).

SOURCE  Swift Biosciences

CONTACT: Darby Wagner, Lambert, Edwards & Associates, +1 (616) 258-5779,

dwagner@lambert-edwards.com